Die lineare Reihenfolge (also ohne CSS, oder wie im Quelltext) der Inhalte einer Seite spielen für Google eine Rolle. Inhalte, die weiter vorne stehen, werden von Google als wichtiger gewertet.
Daher sollte Navigation und der primäre Inhalt ganz oben stehen, danach erst sekundäre Inhalte (Sidebar, Footer) folgen.
Ein positives Beispiel ist Wikipedia: Hier ist die Artikelüberschrift das allererste, was ganz oben im HTML-Body steht.